CT技术只能探测组织密度差异，而MRI具有极佳的组织对比度、多平面成像能力、对流动血液的敏感性及无电离辐射，特别适用于胸部软组织病变的检出及诊断，尤其适用于对辐射敏感的人群（如孕妇、儿童）。胸部的软组织包括：心脏、纵隔、胸膜及胸壁等。而对于肺内疾病，由于MRI技术受到生理性呼吸运动引起的运动伪影，含有大量气体导致的低信号强度以及肺内空气/软组织界面导致的磁场不均匀性的影响，应用受限。

　　当评估以下胸部组织病变时，MRI优于或等同于CT检查：（1）评估肺尖（如肺上沟瘤血管神经侵犯的评估）、膈和脊柱（特别适用于椎旁肿块）疾病；（2）评估胸膜疾病（如胸膜间皮瘤累及范围的评估；区分渗出液、漏出液和血胸等胸腔积液）；（3）能准确诊断CT扫描中怀疑为纵隔复杂囊肿的占位（如高密度的支气管囊肿）；（4）评估周围型肺癌的累及范围，特别是胸壁侵犯，以及血管侵犯的界定；（5）骨髓转移；（6）主动脉瘤和主动脉夹层的类型及范围，对真假腔的准确显示且无需注射对比剂。

　　当评估以下胸部组织病变时，CT检查仍优于MRI：评估肋骨骨折；评估肺实质疾病；评估纵隔淋巴结和淋巴瘤分期；评价骨皮质转移瘤；肺癌的分期；显示肺栓塞的栓子；高危患者早期肺癌筛查的工具。